Мечеть была построена в 1865 году мастером Ага Мухаммедом Гулу оглы как маленький одиночка. Но в 1904 году житель села Хаджи Сафарали расширил район и построил большую мечеть. В 1930-х годах мечеть, которая была упразднена, превратилась в зернохранилище. Общая площадь 2600 кв.м. Место поклонения для женщин находится на втором этаже.

В селе Новханы также есть старинные мечети. Одной из них является мечеть Шах Султан Хусейн 17 века, сохранившаяся в центральной части села. Мечеть Хаджи Сафарали была построена в середине 19 века и имеет своеобразную структуру. В советский период мечеть была также закрыта как место поклонения, и использовалась в качестве зерновой мельницы колхоза. Наконец, после восстановления независимости Азербайджан продолжал функционировать в качестве мечети.

Мечеть отремонтирована в соответствии с абшеронскими архитектурными традициями, возведены два минарета. Объект был отремонтирован, все необходимые технические вопросы были решены на высоком уровне, реконструкция была завершена в 2007 году. Комплекс мечети Хаджи Сафарали является одним из красивейших религиозных храмов Абшерона.